Dr. Jon Smith ezredes; a Covert-Oneügynöke Hollandiában részt vesz egy fertőző betegségekkel foglalkozó tudományos konferencián. Egyik éjjel a szállodáját támadás éri; a terroristák vérfürdőt rendeznek, és elrabolnak néhány különleges és veszélyes vírusmintát. Smith a szerencséjének és egy CIA-ügynöknek köszönhetően megússza a merényletet, de tudomására jut, hogy néhány más személlyel együtt felkerült egy bérgyilkos halállistájára. Ugyanazon az éjszakán megszökik a börtönből egy terrorista hadúr, aki egy különleges, új fegyverrel akarja térdre kényszeríteni a világot, hogy így álljon bosszút az őt bíróság elé állító nagyhatalmakon. Menekülés, öngyilkos merénylők és bérgyilkosok, kétségbeesett nyomozás és hajsza a szökevény után, informatikai zsenik és egy áruló a CIA-n belül - a kialakuló káoszban egyre biztosabbnak tűnik a feltételezés, hogy az események összefüggnek, a mozaikok egymás mellé illeszthetőek, és a kialakuló kép az emberiségre váró borzalmas jövőt ábrázolja. Csupán egyetlen szervezet létezik, amely megakadályozhatja ennek a jövőnek a valóra válását: a Covert-One..